越来越多的政策支持国产高通量测序仪的发展，圣湘生物积极响应国家号召，布局高通量二代测序仪市场，推出国产SansureSeq 1000高通量测序仪，多项关键技术填补国内空白。国内首款实现双芯片滚动上机的高通量测序仪，可实现一张芯片运行中随时加载第二张芯片开始工作，且两张芯片可根据客户需求产出不同读长的数据或相同测序类型的数据，缩短等待时间、扩大应用范围。
图1. 圣湘生物SansureSeq1000高通量测序仪
首先，国产测序仪SansureSeq 1000平台可开放式实现多方向应用开发，其中仅从临床热门感染微生物检测应用方向看，根据世界卫生组织（WHO）发布的数据，患感染性疾病死亡人数占全球死亡总人数的28%。在我国，感染疾病患者占就医总数的49%，每年疑难危重感染患者约2000万人，由此产生的微生物送检量约5000万份，预计2025年病原宏基因组检测（mNGS，metagenomics Next Generation Sequencing）的目标检测量至少为每年500万份，市场规模超百亿元人民币。
宏基 因 组 高 通 量 测 序 技 术（mNGS）通过对临床样本的 DNA 或 RNA 进行高通量测序，可以无偏倚地检测多种病原微生物（包括病毒、细菌、真菌和寄生虫）。可获得疑似致病微生物的种属信息，并提供能够指导临床治疗的分析报告，为疑难危重感染提供快速精准诊断依据。突破传统检测技术上“怀疑什么，检测什么”的限制，具有快速鉴定、全面覆盖、无需预设、无需培养等特点。
图2. 病原微生物宏基因组测序（mNGS）工作流程
SansureSeq1000测序仪开展mNGS检测性能展示
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有效数据量
SansureSeq 1000测序仪在mNGS检测中进行了5轮测试，测序读长为75bp，测序芯片250M reads，文库测序平均有效数据通量为322M，Q30>85%，测序质量良好。
图3. SansureSeq1000测序仪有效数据产出
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测序准确率
根据国家药品监督管理局最新发布的《高通量基因测序仪标准》（标准编号：yy/t 1723-2020）：测序准确率在制造商规定的测序覆盖率和测序平均深度下，符合以下要求：与对应参考序列比对，测序一致序列准确率应不低于99.0％。
SansureSeq 1000测序仪使用企业参考品E.coli和Nextseq 500/CN500测序仪性能评价用参考品phiX重复检测3次，并与Illumina平台对比。测序结果与对应参考序列比对，SansureSeq 1000测序一致序列准确率均≥99%，与Illumina高度一致。
图4. SansureSeq1000测序仪测序准确率
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mNGS病原体检测一致性
mNGS一次检测涵盖细菌、真菌、病毒、寄生虫、支原体/衣原体等病原微生物，测序平台需能够灵敏检测出样本中低载量的病原微生物，SansureSeq 1000测序仪选用15例肺泡灌洗液样本进行测试，测序数据表现与Illumina Nextseq 500/CN500测序仪高度一致，部分样本检出序列数甚至高于Illumina Nextseq 500/CN500测序仪。
图5. 7例结核分枝杆菌样本检出序列数比较
图6. 肺炎支原体、烟曲霉、耶氏肺孢子菌样本检出序列数比较
图7. 2例混合感染样本检出序列数比较
SansureSeq1000测序仪技术优势
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独特的“滚动上机”
可实现一张芯片运行中随时加载第二张芯片开始工作，且两张芯片可根据客户需求产出不同读长的数据或相同测序类型的数据，缩短等待时间、扩大应用范围；
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灵活的测序通量
可提供60M/120M（低通量双芯片FCMi/FCS）、250M（中通量双芯片FCM）、500M（高通量双芯片FCH），支持最大数据产量≥300Gb / run；
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更高的准确性能
高保真的合成测序化学反应体系+独特的表面信号放大技术，最大程度还原基因组原始序列信息，测序结果准确度超过99.9%；
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更广的兼容特性
创新的表面化学修饰，结合高度兼容的引物接头，可无缝适配市面常见的NGS文库体系，稳定高效，无需重新开发建库试剂盒。
图8. SansureSeq1000高通量测序仪边合成边测序
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